Entre 2008 e 2010 realizou um pós-doutoramento em sociologia na FLUP e na universidade de Pádua (itália) sobre o tema Imigração, etnicidades e religião. Em 2011, foi Professora convidada do Departamento de Teologia da Universidade de Uppsala (Suécia) e em 2017 esteve nos EUA com uma bolsa do Departamento de Estado, no âmbito do Programa Fulbright SUSI “Religious Pluralism”. Foi membro do Conselho da International Society for the Sociology of Religion (2013-2021) como representante da Península Ibérica, e é coordenadora nacional da rede EUREL (Sociological and Legal Data on Religions in Europe and Beyond). Foi também membro da direção da Associação Portuguesa de Sociologia (1998-2000) e, em 2018, fundou e coordena a secção de Sociologia da Religião da APS.

Atualmente é membro da direção do Departamento de Sociologia, da direção do Doutoramento em Sociologia e diretora da Revista Sociologia – Faculdade de Letras da Universidade do Porto.

Foi um dos fundadores e membro da primeira direção do IS-UP e coordenou o grupo de investigação “Recomposições Sociais e Território” (2014-2021). Atualmente é membro da Comissão editorial dos livros do IS-UP e investigadora colaboradora do Centro de Investigação em Teologia e Estudos de Religião (CITER) da Universidade Católica Portuguesa.

O seu trabalho científico tem incidido de modo dominante sobre a religião, e.g., pluralismo religioso; migrações, etnicidade e religião; catolicismo português, recomposição de comunidades protestantes e evangélicas. Estas temáticas têm sido investigadas fundamentalmente em várias redes e projetos internacionais e nacionais, dos quais se destacam: “Identidades Religiosas e Dinâmica Social na Área Metropolitana de Lisboa” (2018-2019), financiado pela Fundação Francisco Manuel dos Santos; os projetos realizados no âmbito da rede GERICR, “L’Eglise Catholique face aux nouveaux défis éthiques, sociaux et politiques, posés dans les pays d’Europe Occidentale de tradition catholique” (2007-2010) e  “Las consecuencias sociales de la nueva pluralidad religiosa en países europeos com mayoría histórica católica” (2009-2013), ambos financiados pelo Ministério da Ciência da Espanha; “Imigração, etnicidade e religião: comunidades religiosas e imigrantes da Europa de Leste” (2008-2010), apoiado pela Fundação para a Ciência e a Tecnologia; “Igreja e religião na Europa alargada” (2004-2008), apoiado pela Fundação Volkswagen; "Pluralismo religioso e moral" (1995-2001) e  financiado pela European Science Foundation. Atualmente continua a participar nos projetos em curso da rede EUREL e é membro da equipa do projeto internacional European Interdisciplinary Master African Studies (EIMAS), financiado pela Comissão Europeia e iniciado em dezembro de 2019.

Entre os trabalhos publicados destacam-se:

1. Da Torre de Babel às terras prometidas: pluralismo religioso em Portugal (2006), Afrontamento.
2. Imigração, etnicidade e religião: o papel das comunidades religiosas na integração dos imigrantes da Europa de Leste (2008). Lisboa: Alto-Comissariado para a Imigração e Diálogo Intercultural, 2008.
3. Religião em movimento: migrações e comunidades religiosas na Itália e em Portugal, (2010), Estratégias Criativas, (Coord. com E. Pace.).
4. Portugal: Secularization and Religious Vitality of the Roman Catholic Church in a Southern European Country (2012). In Pollack D., Müller O., Pickel, G. (Eds.) The Social Significance of Religion in an Enlarged Europe: Secularization, Individualization and Pluralization. (pp. 77–93.
5. Portrait du Catholicisme au Portugal (2012). In  A. Perez-Agóte, Portraits du Catholicisme : une comparaison européenne, Presses Universitaires de Rennes, (coautoria com M. João Oliveira).
6. Ethical Challenges of the Catholic Church in Portugal: The Case of Same-Sex-Marriage (2015). In K. Dobbelaere & A. Perez-Agóte (Coord.) The Intimate: New Conflicts between Religion and Politics), KADOC, Leuven University Press, (coautoria com M. João Oliveira).
7. The Changing Soul of Europe: Religions and Migrations in Northern and Southern Europe, (2014). Farnham, Ashgate, (Ed. with E. Pace, I. Furseth and P. Pettersson).
8. A religião na cidade: territórios, materialidades e comunicação. Sociologia. Revista da Faculdade de Letras da Universidade do Porto, Temático (Processos sociais e questões sociológicas), 12–27, 2017.
9. Identidades religiosas e dinâmica social na Área Metropolitana de Lisboa (2019), Lisboa: FFMS, (Coord. Alfredo Teixeira).
10. A Religião no espaço público português (2019), Lisboa: INCM, (coautoria com M. João Oliveira).
11. Catolicismo: quo vadis? In P. Zaqueu-Higino; P. Andrade; R. Portella (orgs.). Catolicismo, quo vadis? Os rumos da Igreja Católica. Rio de Janeiro: Resistência Acadêmica, pp. 65-82.
12. Teixeira, Alfredo; Vilaça, Helena; Steffen, Dix (2020). Believers without Religion: Trends and Paradoxes in Portuguese Society.  Journal of Religion in Europe, 1-29. DOI: https://doi.org/10.1163/18748929-20201474
13. Vilaça, Helena (2020). A relação dos protestantes e evangélicos com a política em Portugal: das origens à atualidade. In D. Rodrigues & N. Lellis (Org.), Religião e Política: o contexto da lusofonia. São Paulo: Editora Recriar, 17-35. ISBN 978-65-86242-35-5